Sous l’autorité du Directeur général, le BOM est rattaché au Secrétariat général de la Présidence de la République. 
Le BOM concentre  ses activités dans les  domaines  de la rationalisation des procédures et des structures administratives, du renforcement des capacités des agents de l’Etat, de l’évaluation des politiques publiques. 

Dans tous ces domaines, la stratégie du BOM s’appuie sur les principes suivants :
          - le « faire » dans les domaines d’études où le BOM possède des compétences distinctives en matière d’organisation ou de réorganisation de structures administratives ;
          - le « faire avec » en joignant à son équipe des spécialistes d’autres structures administratives, des consultants ou des cabinets spécialisés, choisis pour leur expérience et leur expertise,  lors des missions conjointes de grande envergure ;
         - le « faire-faire » sur la base de la contractualisation avec des consultants aux compétences pointues, pour réaliser des études dans des domaines où elle-même ne présente pas de compétence distinctive, et pour des raisons d’efficacité et d’efficience.

Les ressources humaines sont constituées par un personnel cadre et un personnel d’appui. Le personnel cadre comprend les conseillers en organisation. Ces derniers sont spécialisés dans le cœur de métier de la structure.  Les conseillers en organisation disposent d’une expérience au sein de l’Administration publique et de compétences avérées en management.